28 нюня 1578 года страшный пожар в Казани, начавшийся около церкви святителе Николая Тульского, уничтожил часть города и обратил в пепел половину Казанской Кремля.
Злорадствовали поклонники Магомета (которых в то время было в городе большинство), думая, что их Бог прогневался на христиан.
Однако город вскоре начал вставать из руин. Вместе с другими погорельцами недалеко от места начала пожарища строил дом стрелец Даниил Онучин.

Его девятилетней дочери Матроне явилась во сне Божия Матерь и повелела достать Ее икону, зарытую в земле еще при господстве мусульман тайными христианами. На слова девочки не обратили внимания. Трижды являлась Богородица и указывала место, где укрыта чудотворная икона.

Наконец Матрона со своей матерью стали рыть в указанном месте и обрели святую икону. На место чудесного обретения прибыл во главе духовенства архиепископ Иеремия и, после молебна перенес святой образ с Крестным ходом в Благовещенский собор, первый православный храм города Казани, воздвигнутый Иоанном Грозным. Во время шествия получили исцеление два слепца — Иосиф и Никита.
Список с иконы, явленной в Казани, рассказ о ее обретении и описание чудес были посланы в 1579 году в Москву. Царь Иоанн Грозный повелел устроить на месте явления храм в честь Казанской иконы Божией Матери, где и поместить святую икону, а также, основать женский монастырь. Матрона и ее мать, которые помогли обрести святыню, приняли постриг в этой обители.
В Никольском храме, где совершался первый молебен пред Казанской иконой, был в то время священником будущий Патриарх Ермоген, святитель Московский. Через 15 лет, в 1594 году, уже будучи митрополитом Казанским, он составил сказание о священных событиях, очевидцем и участником которых был.
Святой Ермоген в период польского нашествия, который народ назвал "Смутным временем" (1605-1612), был уже Патриархом Московским и всея Руси. В трудные дни, когда Москва была занята поляками, а по стране ширились усобицы, непреклонный страдалец за Святую веру и Отечество, находясь под стражей, сумел тайно отправить в Нижний Новгород воззвание.
Нижегородцы откликнулись на призыв первосвятителя. Собранное ополчение возглавил князь Димитрий Михайлович Пожарский. Присоединившиеся к ополчению казанские дружины принесли с собой список с Казанской чудотворной иконы, которую в Ярославле передали князю Димитрию. Пресвятая Владычица взяла ополчение под покровительство, и ее заступничеством была спасена Россия. В осеннюю непогоду двинулось русское воинство на штурм Москвы, находившейся в руках поляков. Штурму предшествовал трехдневный пост и усердная молитва пред Казанской иконой Божией Матери.
В осажденном Кремле, в плену находился прибывший из Греции, тяжело больной архиепископ Элассонский Арсений (впоследствии архиепископ Суздальский). Ночью келья святителя Арсения вдруг озарилась Божественным светом, он увидел Преподобного Сергия, который сказал: "Заступничеством Богородицы завтра утром Москва будет в руках русского воинства". Как бы в подтверждение истинности пророчества архиепископ получил исцеление от болезни. Святитель послал известие об этом радостном событии русским воинам. На следующий день, 22 октября 1612 года, русские войска одержали крупную победу и взяли Китай-город, а через 2 дня — Кремль. В воскресенье, 25 октября, русские дружины торжественно, с Крестным ходом, вошли в Кремль, неся Казанскую икону. На Лобном месте Крестный ход был встречен вышедшим из Кремля архиепископом Арсением, который нес Владимирскую икону Богородицы, сохраненную им в плену. Потрясенный свершившейся встречей двух чудотворных икон Богородицы, народ со слезами молился Небесной Заступнице. После изгнания поляков из Москвы князь Димитрий Пожарский поставил святую Казанскую икону в своей приходской церкви Введения во храм Пресвятой Богородицы на Лубянке в Москве. Позже на Красной площади был воздвигнут Казанский собор. Святая икона, бывшая в войсках Пожарского при освобождении Москвы, в 1636 году перенесена была в ново-устроенный храм. Ныне этот святой образ находится в Богоявленском Патриаршем соборе Москвы.